病毒感染宿主后，宿主天然免疫反应如何适时适度的启动以清楚病毒，而在感染晚期被适时终止从而避免免疫损伤、炎症和自身免疫疾病，一直是过去几十年中免疫学领域的关键科学问题。舒红兵研究组在该领域做出了原创性和系统性的贡献，成为该领域国际上最重要的研究组之一。
　　1）发现了抗RNA病毒天然免疫信号转导的关键接头蛋白VISA。RNA病毒感染宿主细胞后，其病毒RNA被细胞浆中的受体识别，然后激活下游一系列的信号转导过程，诱导抗病毒基因表达，进而启动抗病毒天然免疫。舒红兵研究组发现了在该信号转导过程中具有“平台”或“中转站”作用的关键接头蛋白并将其命名为VISA。相关论文在Molecular Cell发表后，已经被SCI他引1049次（包括20篇Cell/Nature/Science刊载论文，29本专著或教科书），成为抗病毒天然免疫领域的经典文献之一。VISA的发现被认为为 “是了解宿主早期抗病毒免疫的重要路标……是通向天然免疫的无价的连接”，相关论文被The Scientist杂志选为“热点论文”，入选Science杂志列出的“2005年细胞信号转导领域的重大突破”。
　　2）发现了抗DNA病毒天然免疫的关键接头蛋白MITA。舒红兵研究组发现了抗DNA病毒天然免疫信号转导过程中的关键接头蛋白，并命名为MITA发现MITA通过招募下游的TBK1蛋白激酶和IRF3转录因子，诱导抗病毒基因表达。MITA的发现，是抗DNA病毒天然免疫分子机制研究中具有里程牌意义的成果。相关论文在Immunity发表后，成为天然免疫领域的经典文献之一，已经被SCI他引471次。MITA的发现被认为“填补了病毒核酸信号转导中的一项空白并推动了对抗病毒天然免疫的了解”。值得一提的是，鉴于MITA在癌细胞DNA诱导的肿瘤免疫中的关键作用，MITA已经成为国际大型医药公司研制新一代肿瘤免疫治疗药物的重要靶标。
　　3）阐述了抗病毒天然免疫信号转导的重要调节机制。宿主抗病毒天然信号转导过程受到严密而精细的调控，从而确保既清除病毒又避免免疫损伤和自身免疫疾病。舒红兵研究组发现了多种在时空上精细调控抗病毒天然免疫的机制。例如，多个蛋白通过调控病毒核酸受体/接头蛋白在不同时空维度的泛素化/苏素化修饰，细胞内转运，复合物形成，调控抗病毒天然免疫的适时启动和终止或抗病毒免疫的强度。
　　在国际重要学术刊物发表论文147篇，被SCI引用10000余次；主编了《抗病毒天然免疫》，牵头撰写了《中国学科发展战略·免疫学》；作为第一完成人获得国家自然科学二等奖两次、教育部自然科学一等奖两次。该项目共培养了55名博士生，其中17名已经成为高校或科研院所教授、副教授。舒红兵获得了《Nature》杂志在中国首次颁发的“杰出导师奖”。